2046年2月27日，在宝可梦五十周年的宝可梦日，任天堂发布了一款名为《宝可梦世界》的最新宝可梦游戏和机体。本作的游戏结合了虚拟潜行技术，建立了一个真正属于宝可梦们的世界。每个玩家都可以在这个世界中与自己心爱的宝可梦一起成长，一起生活。
故事发生在宝可梦最新作朱紫中的帕底亚地区，宝可梦大师小智之子“诺言”的成长故事。在成为宝可梦大师的路上，诺言将会邂逅各种各样得人和不同的宝可梦，参加校园里的日常以及道馆挑战赛，甚至是阻止反派的阴谋……
历史上最年轻的天王级训练家，最优秀的培育家，五星级大厨，宝可梦研究专家林柒耸耸肩：“众所周知，训练家是我的副业。”
“王洸志”因失恋在网吧熬了七天七夜，以为要死了，却意外绑定了签到系统穿越到了神奇宝贝的世界，并在签到中获得了简化版琦玉锻炼法，重活一世的王洸志不甘堕落下去，决心修炼，从此神奇宝贝世界多出了一位最强神奇宝贝训练家，兼地表最强光头。
“为什么你的黄皮耗子跟我的不一样。”“孩子，我这个不是黄皮耗子，是迪莫！”“那为什么我的图鉴里没有它？”一个小孩指着身后正在喷火烧着流氓熊猫尾巴的业炎冥古龙。“求求你别烧了，他本来尾巴就不长！”
从公元前210年秘境降临在秦始王出巡的路上开始，世界各地不断出现这种亚空间。无数宝可梦从那些秘境中进入蓝星。刘秀指挥着固拉多光复汉室。十六世纪八十年代发现球果，开启第一次精灵球革命。十九世纪中期精灵球种类变多，进入第二次精灵球革命。无数训练家在这个时候自发组织形成了最早的全球性组织--训练家协会。1914年1939年两次超级秘境的降临中，训练家协会为了拯救人类而消亡，随意诞生了宝可梦联合会。
选择一、努力成为本世纪最强训练家，带领人类正确认识每一只宝可梦，打造八大道馆体系、创立华丽大赛、开展世界冠军赛......选择二、教固拉多飞行。选择三、用单身30年为代价，换取走向最强训练家之路。【叮...宿主从其中选择一种方可解锁神级训练家系统】望着蓝色屏幕上的三种选择，高中生林彦陷入沉思。“你确定这是选择题？”“这分明是单选题吧！”无奈下，林彦忍不住叹了口气。“唉~”生命不易，小林叹气。为了解锁系统，林彦背上行囊。勉为其难接受了这任重而道远的普及任务。这是一个宝可梦灵气复苏短短五年的平行世界。在没有任何人了解它们的情况下，宝可梦被人们称为“异兽”，训练家变成了“御兽使”。看着这样的世界，林彦脑海中闪过一个大胆的想法。“既然如此，就让我来创造一个理想中的精灵盛世吧！”
